MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021081	CCA	2	6	3051712	3051717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_021081	GCC	2	6	3051735	3051740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_021081	AGGG	2	8	3051785	3051792	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_021081	ATT	2	6	3051837	3051842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_021081	GAA	2	6	3051873	3051878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021081	TA	3	6	3051884	3051889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021081	TAC	2	6	3052495	3052500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_021081	TATT	2	8	3052565	3052572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_021081	CCT	2	6	3052575	3052580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_021081	ACCC	2	8	3052612	3052619	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5511	NC_021081	GC	3	6	3052677	3052682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_021081	AGT	2	6	3052704	3052709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_021081	CCT	2	6	3054060	3054065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_021081	A	6	6	3054086	3054091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021081	CCAG	2	8	3055501	3055508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_021081	GCAT	2	8	3056564	3056571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_021081	CCT	2	6	3056574	3056579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_021081	CTG	2	6	3056716	3056721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_021081	CATTAT	2	12	3056744	3056755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5520	NC_021081	TCC	2	6	3060715	3060720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_021081	AAC	2	6	3060778	3060783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_021081	GGTTC	2	10	3060803	3060812	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5523	NC_021081	TCT	2	6	3060815	3060820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_021081	GAT	2	6	3060824	3060829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021081	A	6	6	3060916	3060921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_021081	CT	3	6	3060959	3060964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_021081	GCCC	2	8	3065734	3065741	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5528	NC_021081	A	7	7	3065746	3065752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_021081	CCTGG	2	10	3065753	3065762	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5530	NC_021081	CCAGG	2	10	3065768	3065777	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5531	NC_021081	CCCA	2	8	3066964	3066971	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5532	NC_021081	ACA	3	9	3067877	3067885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_021081	GGCA	2	8	3068170	3068177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_021081	TCC	2	6	3071625	3071630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_021081	AACCA	2	10	3071676	3071685	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5536	NC_021081	GTTTG	2	10	3071953	3071962	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021081	CCT	2	6	3075684	3075689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_021081	CTAT	2	8	3075699	3075706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_021081	CTT	2	6	3075766	3075771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_021081	CTG	2	6	3078042	3078047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_021081	T	6	6	3078770	3078775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021081	T	6	6	3081668	3081673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021081	CTTT	2	8	3082503	3082510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_021081	GCCA	2	8	3082523	3082530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_021081	A	6	6	3082583	3082588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_021081	ACGGG	2	10	3082616	3082625	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5547	NC_021081	TGCA	2	8	3082685	3082692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5548	NC_021081	AGG	2	6	3082719	3082724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021081	AAT	2	6	3086704	3086709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021081	CCT	2	6	3088539	3088544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_021081	GGGC	2	8	3088583	3088590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_021081	CCT	2	6	3088593	3088598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_021081	T	6	6	3089641	3089646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021081	AC	3	6	3089674	3089679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_021081	GCT	2	6	3089721	3089726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_021081	CGG	2	6	3092567	3092572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_021081	GCCC	2	8	3094112	3094119	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5558	NC_021081	A	6	6	3094146	3094151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021081	TGG	2	6	3094196	3094201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_021081	GGCA	2	8	3094386	3094393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_021081	GGC	2	6	3094601	3094606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_021081	TCA	2	6	3094641	3094646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_021081	AGC	2	6	3094707	3094712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_021081	TCC	2	6	3094744	3094749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_021081	GGC	2	6	3095423	3095428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_021081	CAC	2	6	3095445	3095450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_021081	GAG	2	6	3095451	3095456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021081	GCC	2	6	3095462	3095467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_021081	GGCCAG	2	12	3095476	3095487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_021081	GCCGC	2	10	3095492	3095501	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5571	NC_021081	ATG	2	6	3095524	3095529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_021081	AC	4	8	3095620	3095627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_021081	TAG	2	6	3096115	3096120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_021081	CCT	2	6	3096123	3096128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_021081	TGGG	2	8	3096141	3096148	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021081	CAGGGC	2	12	3096191	3096202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_021081	GAG	2	6	3096212	3096217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_021081	CCCACC	2	12	3096225	3096236	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
5579	NC_021081	TGC	3	9	3096278	3096286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_021081	ACCAG	2	10	3096338	3096347	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5581	NC_021081	TTA	2	6	3096739	3096744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_021081	AGC	2	6	3096768	3096773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_021081	AGTC	2	8	3096805	3096812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_021081	CAAG	2	8	3096870	3096877	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_021081	CCG	2	6	3096907	3096912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_021081	C	6	6	3096920	3096925	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5587	NC_021081	GCC	2	6	3096939	3096944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_021081	CAAG	2	8	3097047	3097054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_021081	TTTC	2	8	3097062	3097069	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5590	NC_021081	CCG	2	6	3097087	3097092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_021081	C	6	6	3097100	3097105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5592	NC_021081	CAG	2	6	3097201	3097206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_021081	AGT	2	6	3097220	3097225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021081	GTT	2	6	3097234	3097239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021081	GGT	3	9	3097248	3097256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_021081	CCA	2	6	3097319	3097324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_021081	T	7	7	3098198	3098204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021081	GTGG	2	8	3098301	3098308	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021081	GGC	2	6	3098381	3098386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_021081	GCA	2	6	3098772	3098777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_021081	N	100	100	3098782	3098881	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.